從五次元而來的邪惡軍團“嘉克帝國”開始準備進攻地球了。而阻擋他們的是從古代開始就保護地球的艾魯多蘭和他所駕駛的雷神王。可是，雷神王被帝國的司令官貝路塞夫卑鄙的手段所傷，而墜落到地球…… 

　　雷神王墜落到陽升學園裏，艾魯多蘭將操縱雷神王的雷神金屬托付給5年3班的學生後逝去……就這樣，只有小學生參加的「地球防衛組織」成立。 

　　第二天，嘉克帝國的機器人廢氣邪惡獸·艾提索斯出現。這時，學生們手中的雷神金屬閃耀出光芒，當白鳥瑪麗亞將雷神金屬放到課桌上時，教室變成了司令部。三位學生日向仁、月城飛鳥和星山吼兒成為了劍王、鳳凰和獸王的駕駛員，出擊迎戰“嘉克帝國”的邪惡獸。 

　　在戰鬥中，小島勉發現三臺機器人可以合體，三人最後合體成雷神王，成功地打倒了邪惡獸。 

　　就這樣，小學生組成的「地球防衛組織」和邪惡的嘉克帝國的戰鬥開始了……